Izgradnja samostana Santo Domingo započela je 1551. godine, godine u kojoj je Općina Oaxaca dodijelila franjevcima dominikancima mjesto za izgradnju u razdoblju od najmanje 20 godina.
1572. samostan nije samo dovršen, već su radovi već kasnili. Općina i dominikanski red postigli su dogovor da se rok produži za još 30 godina u zamjenu za pomoć fratra u radovima vodovoda za grad. Tijekom ova tri desetljeća radovi su imali uspona i padova zbog nedostatka sredstava i 1608. godine, nova zgrada još uvijek nedovršena, dominikanci su se morali tamo preseliti jer je samostan San Pablo, u kojem su živjeli dok se gradio novi hram, srušen potresima 1603. i 1604. Prema Fray Antonio de Burgoa, kroničar reda, arhitekti samostana bili su Fray Francisco Torantos, Fray Antonio de Barbosa, Fray Agustín de Salazar, Diego López, Juan Rogel i Fray Hernando Cabareos. 1666. godine samostanska djela su prekinuta, započinjući druga, poput kapelice krunice koja je svečano otvorena 1731. Tako je tijekom 18. stoljeća Santo Domingo rastao i obogaćivao se s bezbroj umjetnina, sve dok nije postao magna reprezentativno djelo tri stoljeća vicekraljevstva u Oaxaci.
Njegovo uništavanje započelo je s 19. stoljećem. Od 1812. godine sukcesivno su je okupirale trupe s različitih strana u sukobu, proizašle iz ratova koji su se dogodili od Neovisnosti do Porfirijata. 1869. rušenjem četrnaest oltarnih slika, koje je odobrio general Félix Díaz, nestalo je mnoštvo umjetnina, vrijednih slika, skulptura i rezbarenih srebrnih predmeta.
Dvadeset godina kasnije, nadbiskup Oaxace, dr. Eulogio Gillow, predstavio se vladi Porfirio Díaz kako bi oporavio hram, započinjući njegovu obnovu uz pomoć uglednog oaxacanskog don Andrésa Portilla i dr. Angela Vasconcelosa.
Dominikanci su se vratili do 1939. Do tada je uporaba vojarne utjecala na njezinu strukturu i izmijenila organizaciju unutarnjih prostora, uz to je izgubljen velik dio slikovne i skulpturalne ornamentike izvornog klaustra. Međutim, vojna okupacija, koja je trajala 182 godine, spriječila je da se samostan proda i podijeli tijekom rata u Reformaciji.
Hram se vratio u izvornu uporabu krajem devetnaestog stoljeća, a 1939. dominikanci su oporavili dio samostana. Godine 1962. izvedeni su radovi na pretvaranju područja oko glavnog klaustra u muzej, a radovi su zaključeni 1974. spašavanjem ukupne površine starog atrija.
Arheološka istraživanja omogućila su sa sigurnošću utvrditi kako su riješene naslovnice spomenika; odredite razine. podovi tijekom uzastopnih zanimanja; poznavati autentične arhitektonske elemente i izgraditi važnu zbirku keramike izrađene između 16. i 19. stoljeća. U obnovi je odlučeno koristiti izvorne građevinske sustave i uključen je velik broj radnika iz same države. Na taj su način spašeni zanati koji su bili u zaboravu, poput kovanja željeza, stolarije od tvrdog drveta, izrade opeke i drugih aktivnosti koje su majstori Oaxacana majstorski obavljali.
Usvojen je kriterij maksimalnog poštivanja izgrađenog djela: neće se dirati zid ili izvorni arhitektonski element, a projekt će se modificirati kako bi se uvijek prilagodio prikazanim nalazima. Na taj je način pronađeno nekoliko izvornika koji su bili pokriveni i zamijenjeni zidovi koji su nestali.
Kompleks, koji je vratio velik dio nekadašnjeg sjaja, izgrađen je kamenim zidanim zidovima prekrivenim zelenim kamenolomnim kamenom. Samo na drugom katu ima nekoliko ciglenih zidova. Originalni krovovi koji su sačuvani i zamijenjeni su svi svodovi od opeke različitih vrsta: postoje svodovi s bačvama s polukružnim lukom; drugi čija je smjernica luk s tri središta; nalazimo i sferne i eliptične svodove; svodni preponi na spoju dva svodna cijevi i, iznimno, kameni rebrasti svodovi. Obnova je otkrila da su u neko vrijeme nestali svodovi bili uništeni, a u nekoliko slučajeva zamijenjeni drvenim gredama. To je provjereno prilikom izrade uvala koje su pokazivale ožiljke smještene na vrhu zidova od kojih su polazili izvorni svodovi.
Uz to, napravljena je dokumentarna povijesna istraga i utvrđeno je da je kroničar dominikanskog reda Fray Francisco de Burgoa, opisujući samostan 1676. godine, kasnije primijetio: „To je spavaća soba nakon nesretnog zatvaranja, bačvastog svoda i s jedne i s druge strane s drugim redovima ćelija, a svaka je nadsvođena niša s proporcionalno osam vara; i svaki s jednakim rešetkama, na istoku i na zapadu drugi.
Kubler u svojoj Povijesti arhitekture iz šesnaestog stoljeća spominje sljedeće: „Kad su dominikanci iz Oaxace u sedamnaestom stoljeću zauzeli svoju novu zgradu, zasvođene prostorije još su uvijek imale drvo od lanaca, možda zbog dugog vremena potrebnog za izgradnju. postaviti minobacač ".
Što se tiče samostanskog vrta, predloženo je da se obnovi kao povijesni etnobotanički vrt, s uzorkom biološke raznolikosti Oaxace, te da se obnovi vrt ljekovitih biljaka koji su postojali u samostanu. Arheološka istraživanja dala su izvanredne rezultate, jer su stari odvodi, dijelovi jezera,. sustav navodnjavanja zasnovan na kanalima, cestama i nekim ovisnostima, kao što su praonice rublja.
Posjetitelji grada Oaxace sada imaju priliku u svoj plan putovanja uključiti posjet najrelevantnijem povijesnom spomeniku u državi.
