Vjerojatno je početkom 16. stoljeća u regiji današnjeg Guanajuata živjela autohtona Chichimecas, uglavnom mjesto zvano Paxtitlán, gdje je bilo puno žaba.
Očito su Taraskanski Indijanci koji su ih pratili dali ime Quanashuato, "planinsko mjesto žaba". Poznato je da su do 1546. godine Španjolci već istražili to područje i da je Rodrigo Vázquez osnovao ranč. Između tog datuma i 1553. godine došlo je do važnih otkrića nalazišta minerala zlata i srebra, a najznačajnije je to učinio Juan de Rayas 1550. Do sljedeće godine u tom su se mjestu smjestila četiri logora ili kraljevske porodice za brigu o novootkrivenim rudnicima. , među njima najvažniji pod nazivom Santa Fe.
Iako su Chichimecas napadali s određenom učestalošću, Real de Minas podignut je kao ured gradonačelnika 1574. godine usvajajući ime Villa de Santa Fe u Real y Minas de Guanajuato. 1679. godine već je imao blazonu ili grb, a 1741. godine dobio je titulu grada zbog "povoljnih pogodnosti koje nude njegovi bogati rudnici srebra i zlata". Kralj Felipe V potpisao je Potvrdu i nazvao je vrlo plemenitim i odanim Kraljevskim gradom Minas de Santa Fe de Guanajuato.
Ovo je mjesto natjeralo na razvoj koji je utvrdio određene urbane karakteristike koje su nastale uslijed topografskih nepravilnosti terena, prilagođavajući raspored naselja i crtajući osebujne ulice, trgove, trgove, uličice i stubišta izvanrednog izgleda, što je okolnost koja je zavrijedila grad koji se smatra jednim od najdivljenijih u našoj zemlji.
U početku su je činile četiri četvrti: Marfil ili Santiago, Tepetapa, Santa Ana i Santa Fe; Smatra se da je potonji bio najstariji i da je tamo gdje je sadašnja četvrt La Pastita. Urbana integracija uključivala je i potok koji je praktički prolazio središtem naselja, pretvarajući ga u Calle Real, koja je bila glavna os grada i na čijim su se stranama, na padinama strmih brežuljaka, gradile kuće njegovih stanovnika. Ova ulica, danas poznata kao Belaunzarán, jedna je od najljepših avenija za svoje podzemne dijelove, svoje mostove i ugodne kutke koje čini na svojoj vijugavoj ruti. Najvažnije i bogate konstrukcije izrađene su u ružičastom kamenolomu, dok su za skromnije korištene cigla i pregradni zidovi, aspekt koji joj je davao karakterističnu boju koja se kreće od crvenkastih tonova do zelene, preko ružičaste; slojevita zemljana posuda korištena je za podove, stubišta i furnire.
Bogatstvo koje je grad postigao prema 18. stoljeću, zahvaljujući bogatim naslagama zlata i srebra, očitovalo se u njegovoj civilnoj i vjerskoj arhitekturi; Međutim, potrebno je imenovati na primjer prvu kapelu, blagoslovljenu 1555. godine, a to je bila Hospital de los Indios Otomíes, oratorij Colegio de Compañía de Jesús, osnovan oko 1589. godine, koja se nalazila tamo gdje su danas Sveučilište i primitivna župna crkva. pod nazivom Bolnice, datiraju iz sredine šesnaestog stoljeća, a danas su djelomično izmijenjene i imaju gravuru na pročelju s likom Gospe Guanajuato.
Grad nudi prostore s izvanrednim ambijentom i lijepim perspektivama, sa svojim trgovima koji uokviruju zgrade od najvećeg interesa, poput San Francisca, gdje završava ulica Sopeña, ispred hrama u San Franciscu, s baroknom fasadom 18. stoljeće koje je u suprotnosti sa susjednom kapelom Svete kuće. Dalje je vrt Union, na čijoj se južnoj strani nalazi čudesni hram San Diega, koji je nekada imao stari samostan; hram je oštećen poplavom, a obnovljen je u 18. stoljeću intervencijom grofa Valenciane. Pročelje joj je u baroknom stilu s churrigueresque zrakom.
Kasnije je Plaza de la Paz, okružena zanimljivim zgradama poput Vladine palače, izvanredne Kuće grofova Rul, djela s kraja 18. stoljeća pripisanog arhitektu Franciscu Eduardu Tresguerrasu, koje ima izvrsnu fasadu i prekrasan vrt. u; kuća grofa Gálveza i kuća Los Chico. Na istočnom kraju trga nalazi se impozantna bazilika Nuestra Señora de Guanajuato, sagrađena u sedamnaestom stoljeću u trezvenom baroknom stilu, u kojoj se u glavnom oltaru nalazi dragocjena slika Gospe od Santa Fe de Guanajuato. Iza bazilike nalazi se još jedan trg koji prethodi raskošnom hramu Družbe Isusove, sagrađenom 1746. godine uz potporu don Joséa Joaquína Sardanete y Legazpija. Zgrada ima jedno od najljepših baroknih pročelja u Meksiku, a ističe se kolosalna kupola koju je u prošlom stoljeću dodao arhitekt Vicente Heredia. Na zapadnoj strani ovog hrama nalazi se kampus Sveučilišta, koji je bio Colegio de la Purísima koji su osnovali isusovci krajem 16. stoljeća; zgrada je doživjela preinake u 18. stoljeću, a neke i sredinom ovog stoljeća. Prema istoku Tvrtka nalazi se Plaza del Baratillo, koja se može pohvaliti prekrasnom fontanom koju je po zapovijedi cara Maximiliana donijela iz Firence, a na zapadnoj strani stoji hram San José.
Nastavljajući ulicom Juárez, prolazite pored Zakonodavne palače, građevine iz 19. stoljeća; dalje je zgrada koja je nekad bila Kraljevska kušnja, izvanredna barokna vila s prvim plemenitim grbom u gradu na pročelju. Odatle, mala poprečna ulica prolazi kroz Plaza de San Fernando da bi stigla do Plazuele de San Roque, šarmantnog kolonijalnog kuta koji uokviruje istoimenu crkvu i koja je najstarija sačuvana, sagrađena 1726. godine. Kompleks zauzvrat daje pristup ugodnom vrtu Morelos, koji prethodi hramu Belén, građevini iz 18. stoljeća s skromnim portalom i prekrasnim oltarnim pločama unutra. S jedne strane hrama, ulica koja ide prema sjeveru vodi do zgrade Alhóndiga de Granaditas; Zamišljena za skladištenje žitarica i hrane, njegova je gradnja započela 1798. godine prema projektu arhitekta Durána y Villaseñora, a završio je 1809. pod nadzorom Joséa del Maza. Njegova je općenita slika prekrasan uzorak neoklasične građanske arhitekture Meksika.
Tipični prostori grada su trgovi i uličice, među kojima možemo spomenuti plazuelu de la Valenciana, Los Ángeles, Mexiamora, poznati i romantični Callejón del Beso i Salto del Mono. Ostale važne vjerske građevine su hram Guadalupe, izgrađen u 18. stoljeću u trezvenom baroknom stilu, hram El Pardo, također iz 18. stoljeća, s pročeljem prepunim biljnih motiva majstorski izvedenim u kamenolomu.
Izvan Povijesnog centra, na sjeveru, nalazi se hram Valenciana posvećen San Cayetanu, čija se izvrsna churrigueresque fasada iz 18. stoljeća uspoređuje s onom Sagrario i Santísima u Mexico Cityju. Hram je sagrađen na zahtjev don Antonija de Obregóna y Alcocera, prvog grofa Valencije, između 1765. i 1788. godine. Ograda čuva nekoliko sjajnih oltarnih slika i dragocjenu propovjedaonicu obloženu kostima i dragocjenim drvetom. Hram Cata također zaslužuje posebnu pažnju. Podignut ispred trga danas poznatog kao Don Quijote, još je jedan od izvrsnih primjera meksičkog baroka, čija se fasada poklapa s Valencianom. Smješteno je u istoimenom rudarskom gradu, a njegova gradnja datira iz 17. stoljeća.
