Redovnici koji su ušli na nenaseljena područja sjevera Nove Španjolske nosili su ideju preobraćenja "barbarskih" nacija na kršćanstvo i tako ih također integrirali u politički život, kako bi kasnije osnovali škole i gradove u selima koja su prethodno osnovali.
Da bi postigli ove ciljeve, roditelji su se uvijek u pratnji naoružanih skupina obraćali poganima i nudili im zaštitu od Crkve i Španjolske krune u zamjenu za dobivanje kršćanskog obrazovanja. Indijanci koji su prihvatili, okupili su se kako bi izgradili misiju, postajući utočište za Indijance i mjesto za učenje evropskih tehnika poljoprivrede i drugih zanata.
Kad je pacifikacija završena, misija je postala novonastali grad s crkvom, dok su se misionari preselili drugdje kako bi ponovno pokrenuli svoje evangelizacijsko djelo. Ovaj je sustav bio rizičan, jer su sjeverni Indijanci sigurno pružili određeni otpor, jer su bili neprijateljski raspoloženiji nego oni u središtu, pa su pobjegli prema planinama.
Preobraćenje je djelovalo na temelju dodjele zemlje i zaštite Indijancima u zamjenu za poslušnost. Oni koji su se protivili kažnjeni su, dok su oni koji su organizirali pobune pogubljeni.
Jednom kada se autohtono pleme okupilo, integrirana je glavna jezgra ili glava koju je činilo nekoliko gradova i sela koji su joj bili podložni. Misionari su boravili u izvorištu i bili su zaduženi za najmanje dva sela koja su obilazila. Tri ili više misionara ovisilo je o rektoru i lokalnom posjetitelju. Te su ustanove zajedno tvorile provinciju.
Prvo je podignuta crkva od kamena i oko nje su, sa ćerpićem, sagrađene kuće za fratre koji će evangelizirati, sunce, kockice i autohtone obitelji, i općenito škola. U ustanovama je postojala ono što bismo mogli nazvati primitivnom ekonomskom strukturom. Imali su površine za obrađivanje, sjetvu zemlje, otvaranje puteva i navodnjavanje; uzgoj stoke, povrća i zanatske djelatnosti. U školama se podučavao katekizam, čitanje, pisanje i glazba.
Kako je vrijeme prolazilo, neke su misije potpuno napuštene zbog raznih događaja, poput protjerivanja isusovaca 1767., širenja bolesti koje su donijeli Španjolci, napada "barbarskih" Indijanaca, vremenskih prilika, velike udaljenosti i malo novca za njihovo održavanje. Neke su danas sačuvane kao crkve, a druge danas čine populaciju od velike važnosti. Međutim, od nekih misija poznato je samo mjesto njihovog početnog smještaja, a od drugih su ostale samo ruševine.
Isusovci su uspostavili misije u Baja California California Norte i Sur, Sonora, Sinaloa, Chihuahua, sjeverni Nayarit, dio Duranga i Coahuile. Nakon njihovog odlaska, dominikanci su se naselili u sjevernoj Baja California, dok su franjevci evangelizirali Tamaulipas i Nuevo León i zamijenili misionare Reda Loyola u južnom dijelu Donje Kalifornije, Sonora, Sinaloa, Chihuahua, Nayarit, Durango i Coahuila. U sjevernom središtu, nakon pobune Zacatecosa - što je spriječilo nastavak franjevačkih misija - autohtoni narod organizirao se u samostane.
1563. kapetan Francisco de Ibarra obišao je teritorij koji uključuje trenutnu državu Sinalou i osnovao neke gradove. Međutim, to nije dugo potrajalo i tek 1591. godine, naredbama guvernera Nueve Vizcaye, očevi isusovci Gonzalo de Tapia i Martín Pérez dobili su nalog za evangelizaciju regije.
Redovnici su prešli Sierra Madre Occidental u svibnju iste godine, ulazeći kroz Acaponetu, Nayarit i prolazeći kroz Culiacán stigli su do mjesta, gdje su 6. lipnja 1591. osnovali svoju prvu zgradu: San Felipe de Sinaloa.
