Povijest grada koji se izvorno zvao Kraljevina Nova Galicija nastavlja se.
Tu je i stari isusovački kolegij Santo Tomás de Aquino, izgrađen u posljednjem desetljeću 16. stoljeća i koji je 1792. godine zauzelo Sveučilište. Od građevine je ostalo samo ono što je bila crkva s monumentalnom kupolom iz prošlog stoljeća i priloženom kapelom Loreto, koju je 1695. sagradio Juan María de Salvatierra. Hram San Juan de Dios, koja je prije bila kapela Santa Veracruz, koju je u 16. stoljeću izgradio don Pedro Gómez Maraver, sagrađen je u 18. stoljeću s baroknom fasadom trijeznih karakteristika. Crkvu La Merced, s baroknim stilom sličnim onom u San Juan de Diosu, iako je više ukrašena, osnovali su u 17. stoljeću fratri Miguel Telmo i Miguel de Albuquerque.
Hram La Soledad sagrađen je krajem 17. i početkom 18. stoljeća na zahtjev Juane Romane de Torres i njezinog supruga, kapetana Juana Bautiste Pandure. Na tom mjestu nalazilo se bratstvo Gospe od Samoće i Svetog groba, zauzimajući kapelu posvećenu San Franciscu Xavieru. Hram i škola u San Diegu, djelo stoljeća XVII; prvi s vrlo trijeznom fasadom za koju se čini da već pripada neoklasičnom stilu, a drugi s prekrasnom arkadom koja krasi njegov stari klaustar.
Crkva Jesús María, pripojena istoimenom samostanu, osnovana je 1722. godine; još uvijek čuva svoje barokne fasade, na kojima možete vidjeti velike skulpture koje predstavljaju Sagrada Familia, Virgen de la Luz, San Francisco i Santo Domingo.
Na kraju, važno je istaknuti još tri religiozne građevine koje su se pojavile kao najbolji primjeri, svaki od svoje vrste, razvoja kolonijalne arhitekture u Guadalajari, uglavnom između sedamnaestog i osamnaestog stoljeća. Tako imamo kapelu Aránzazu, sredinom 18. stoljeća, sa svojim znatiželjnim zvonikom i unutrašnjošću ukrašenom veličanstvenim slikama i oltarnim slikama Churrigueresque iz istog razdoblja i koja se smatra najboljom u gradu. Samostan i crkva Santa Mónica, koju je osnovao otac Feliciano Pimentel u prvoj polovici 18. stoljeća; njegov hram izlaže dvostruko pročelje s bogatim ukrasima katalogiziranim kao najbolji primjer bujnog salomonskog baroknog stila. Hram San Felipe Neri, sagrađen 1766. godine od strane arhitekta Pedra Ciprésa, čini skup izvanredne prisebnosti koji u svoje ukrase uključuje elemente s platereskim podsjećanjima, aspekt koji postavlja hram kao najbolju vjersku građevinu u Guadalajari.
U građevinama koje odgovaraju civilnoj arhitekturi postoje neke vrijedne građevine, među kojima možemo spomenuti Vladinu palaču, stare kraljevske kuće koje su izmijenjene u 18. stoljeću prema projektu vojnog inženjera Juana Francisca Espina, iako je fasada bila djelo Miguela Joséa Coniquea. Zgrada je zamišljena u osnovi u baroknom stilu, ali u njoj se već primjećuju određene neoklasične tendencije. Kraljevski uredi, koji su bili u ugašenom Palacio de Medrano, i sudnice funkcionirali su u prostorijama.
Imamo i ono što je bilo Koncilsko sjemenište posvećeno San Joséu, koje je biskup Galindo y Chávez otvorio 1701. godine, a danas ga zauzima Regionalni muzej Guadalajare, sa svojim glavnim klaustrom stupova u toskanskom stilu i baroknim vratima. Poznati Hospicio Cabañas sagrađen početkom 19. stoljeća, slijedeći planove slavnog arhitekta Manuela Tolsáe, režirajući djelo Joséa Gutiérreza, a godinama kasnije dovršen od strane arhitekta Gómeza Ibarre, i koji predstavlja zapažen primjer neoklasičnog stila.
Između ostalih manjih građevina koje su pružale stilsko jedinstvo gradu Guadalajari, možemo spomenuti, iako nisu sve sačuvane: velebni dvorac iz 16. stoljeća koji je stajao ispred nekadašnjeg trga San Sebastián u četvrti Analco. Kuća na Calle de la Alhóndiga broj 114, trenutno Pino Suárez. Rezidencije koje su pripadale obitelji Sánchez Leñero na 37. mjestu i gospodina Dionisia Rodrígueza na 133 na Calle de Alcalde. Kuća Calderón, tradicionalna kolonijalna prodavaonica slatkiša osnovana 1729. godine i smještena na uglu starih ulica Santa Teresa i Santuario, danas Morelos i Pedro Loza; onaj Francisca Velardea, u neoklasičnom stilu, i na kraju onaj koji je bio ljetnikovac Cañedo, smješten ispred stražnjeg dijela Katedrale.
Na periferiji Guadalajare, trećeg grada po veličini u državi, nalazi se stari grad San Juan Bautista Melzquititlán, danas San Juan de los Lagos. Ovaj je grad postao važno vjersko središte zbog velike čudesne tradicije slike Djevice Marije koja čuva svoju baziliku, koju je sredinom 17. stoljeća sagradio don Juan Rodríguez Estrada. U istom gradu možete vidjeti i druge građevine kao što su Hram Trećeg reda, Kapela na Kalvariji, Kapela Prvog Čuda iz 17. i 18. stoljeća. Postoje i važne civilne zgrade među stanovništvom, poput Palače koledža i zgrade Desetine, između ostalih.
U gradu Lagos de Moreno možete vidjeti njegovu glavnu župu, djelo iz 17. stoljeća s prekrasnim pročeljem u stilu Churrigueresque.
Napokon, u San Pedru Tlaquepaqueu postoje neki primjeri barokne religijske arhitekture u regiji, poput župe San Pedro i Soledadova hrama.
